世界以未知原因陷入废土和混乱之中，通过生物技术重生的超级忍者 Katana-007，将在忍者大师的指引下与邪恶的机械生命形态作斗争，收集失落的先进忍术，但忍者氏族更深奥秘等待着他去探寻...